baseタグは、ローカルなどのテスト環境から本番サーバーの画像ファイルやCSSファイルなどを参照するときに便利です。
それをドメインごとに、対応したbaseタグに切り替える方法です。
<?php $host = $_SERVER["HTTP_HOST"]; if($host=="core.konjiki.jp") { echo '<base href="http://core.konjiki.jp/" />'; } else { echo '<base href="http://prontonet.mobi/" />'; } ?>
ローカル環境で制作してテストサーバーで一旦確認し、その後本番サーバーへアップするという手順のとき
最後の本番サーバーへのアップの際、baseタグを書き換える手間が省けます。